近期，華為與昌平實驗室、北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）和化學(xué)與分子工程學(xué)院、深圳灣實驗室高毅勤教授課題組及鵬城實驗室陳杰團隊基于全場景AI框架昇思MindSpore開發(fā)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測模型，在全球持續(xù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測競賽CAMEO（Continous Automated Model EvaluatiOn）獲得全球第一的好成績。這顯示出昇騰AI基礎(chǔ)軟硬件平臺在 AI+科學(xué)計算 領(lǐng)域的強大能力。

　　4月21日最新月榜競賽結(jié)果

　　超越業(yè)界標桿，連續(xù)三周保持全球第一排名

　　蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測是人工智能走進生命科學(xué)的關(guān)鍵成果之一，對生物學(xué)研究意義重大。2020年12月，《科學(xué)》雜志評選了該年度十個重大科學(xué)突破，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的人工智能AlphaFold就是其中非常重要的一項，因此AlphaFold成為生物研究領(lǐng)域的標桿成果，更是一塊重要里程碑。

　　昇思MindSpore蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測模型研發(fā)進展

　　2021年11月，華為昇思MindSpore團隊與昌平實驗室、北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）和化學(xué)與分子工程學(xué)院、深圳灣實驗室高毅勤教授課題組聯(lián)合推出基于AlphaFold2算法的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測推理工具，并在2022年2月實現(xiàn)訓(xùn)練的全流程打通，效率同比提升2-3倍。

　　采用昇騰AI基礎(chǔ)軟硬件平臺后，在混合精度下，單步迭代時間由20秒縮短到12秒，性能提升超過60%。依托昇思MindSpore內(nèi)存復(fù)用能力，訓(xùn)練序列長度由384提升至512。

　　在訓(xùn)練精度接近AlphaFold2的基礎(chǔ)上，昇思MindSpore在算法、規(guī)模和軟硬件支持等方向上持續(xù)改進，本次發(fā)布的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測模型成績持續(xù)刷新業(yè)界記錄、拿下CAMEO競賽第一，是昇思MindSpore在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域的又一里程碑，在填補國產(chǎn)人工智能基礎(chǔ)軟硬件在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域成績空白的同時，更加證明了其價值與優(yōu)越性。

　　由瑞士生物信息研究所和巴塞爾大學(xué)聯(lián)合舉辦的 CAMEO（Continous Automated Model EvaluatiOn）——全球持續(xù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測競賽，被認為是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域最重要的比賽之一。CAMEO 競賽的規(guī)則是，每位參賽者需每周對 20 個由世界范圍內(nèi)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)家最新破解出的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進行預(yù)測，其分數(shù)和名次每周都會進行在線更新。

　　該競賽吸引了眾多世界范圍內(nèi)生物計算領(lǐng)域的前沿模型“選手”基于昇思MindSpore AI框架訓(xùn)練的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測模型，一經(jīng)亮相，便領(lǐng)跑全球。在最近的三周CAMEO競賽中持續(xù)排名第一，意味著昇騰AI基礎(chǔ)軟硬件平臺在AI for Science領(lǐng)域的強大能力。

　　未來，針對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測問題，昇思MindSpore將攜手學(xué)術(shù)科研界更多合作伙伴，在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域共同探索、持續(xù)突破，助力國內(nèi)相關(guān)基礎(chǔ)研究，尤其是生命各分支學(xué)科的進步，推動創(chuàng)新制藥行業(yè)的發(fā)展。